Kongregace Milosrdných sester svatého Kříže byla rozpuštěna v roce 1950. Dalších čtyřicet let sídlila v klášteře kasárna Pohraniční stráže. Kostel byl využit - jako v řadě podobných případů - jako tělocvična. Skutečná devastace areálu začala až po odchodu vojáků, podepsali se na ní vandalové, zloději a špatná nebo žádná údržba.